你问我答 | MegaBOLT生信分析加速器常见问题盘点！（上篇）

《你问我答》栏目搜集了华大智造客户的常问问题，并为大家整理出了不同产品的FAQ，后续将陆续发布，帮助您更好地了解和使用我们的产品。

文章导览：

Q1:MegaBOLT生信分析加速器是怎样的产品？

Q2:MegaBOLT有哪些使用场景？

Q3:MegaBOLT可以为我带来什么收益？

Q4:MegaBOLT支持Reads的长度范围是多少？支持单端（Single-end）测序的Reads吗？支持不等长Reads吗？

Q5:MegaBOLT是否支持动植物等非人类物种？

Q6:多个任务能在MegaBOLT机器上同时运行吗？

Q7:MegaBOLT使用什么算法进行比对？

Q8:MegaBOLT使用什么算法进行变异检测？

Q9:MegaBOLT支持肿瘤分析吗？

Q1:MegaBOLT生信分析加速器是怎样的产品？

MegaBOLT生信分析加速器系列产品(包括MegaBOLT、ZBOLT、ZBOLT Pro)，是华大智造自研专注于高通量测序领域的生物信息分析硬件加速系统。

支持胚系突变(Germline)与体细胞突变(Somatic)的全基因组(WGS)、全外显子组(WES)、Panel靶向测序数据，较经典算法提速百倍。

产品集成ZMART生信应用市场，支持超过百款增值应用，可灵活配置更多拓展功能应用。MegaBOLT快速、集成、易用、经济，可大幅降低计算费用，省时省心，助力您的业务高效开展。

产品主要有桌面工作站及机架式服务器两种，适应各种规模场地的多种场景需求：实验室、医院、研究院所、公司企业。

Q2:MegaBOLT有哪些使用场景？

机架服务器版适用于拥有计算集群的用户，通常是有大量计算任务的场景，如测序工厂、科研中心、商业公司；而工作站版则适用于一站式场景，例如医院或实验室。

Q3:MegaBOLT可以为我带来什么收益？

极大缩短分析时间，WGS（30X）分析时间可以缩短到1/38，WES（100X）分析时间可以缩短到1/42，这可以减少计算资源的压力，安装更少的服务器。

Q4:MegaBOLT支持Reads的长度范围是多少？支持单端（Single-end）测序的Reads吗？支持不等长Reads吗？

MegaBOLT支持Reads长度范围为25bp~1000bp，具体来说MegaBOLT软件中的BWA支持到250bp，Minimap2支持到1000bp，支持单端测序的Reads，支持不等长Reads。

Q5:MegaBOLT是否支持动植物等非人类物种？

MegaBOLT支持非人物种，默认支持最大物种8Gbp，再大需要设置其他参数，如“--mm2-param “-I 16G””。

Q6:多个任务能在MegaBOLT机器上同时运行吗？

可以，MegaBOLT通过任务调度系统管理多个任务。

Q7:MegaBOLT使用什么算法进行比对？

采用Minimap2或BWA-MEM算法。

Q8:MegaBOLT使用什么算法进行变异检测？

MegaBOLT基于GATK 3.8 / GATK4.1版本的HaplotypeCaller进行优化加速，使用完全相同的算法，支持HaplotypeCaller的全部功能。以及DeepVariant变异检测算法。

Q9:MegaBOLT支持肿瘤分析吗？

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