近日,上海序祯达生物科技有限公司(以下简称:序祯达生物)实验室在华大智造DNBSEQ-T7平台上完成了Olink Explore HT产品的适配验证,实验及测序后的数据经过Olink Proteomics(以下简称:Olink)官方验证,得到了100%样本通过QC的好成绩,标志着Olink蛋白组学与DNBSEQ平台兼容取得了新进展,也意味着DNBSEQ-T7平台成功拓展蛋白组学应用。通过序祯达生物、Olink、华大智造三方的合作,为终端用户带来了更多的选择和更好的使用体验。
图1. Olink Explore HT检测实验流程图(测序平台:DNBSEQ-T7)
验证内容
本次验证采用了66例健康男性及66例健康女性的血浆样本,通过Explore HT标准实验流程进行了实验并完成了文库构建,使用MGIEasy Olink文库环化套装将文库环化后上机DNBSEQ-T7平台进行测序(测序策略:SE66,测序时间约5小时),同时在其原有测序平台上机测序,通过比较NPX值的分布情况对不同平台的产出效果进行对比,结果如下:
图2. 不同测序平台NPX值分布的对比
Olink Explore HT文库在DNBSEQ-T7与原有平台的NPX值分析对比结果显示两个平台的结果具有极高的一致性。
此外,验证还选择了12例已知的在性别间显著差异表达的蛋白来验证DNBSEQ-T7平台产出的结果。其中包括了一些在生殖发育中承担重要作用的蛋白, 如INSL3、EDDM3B 和 TEX101。结果发现这12种蛋白的浓度在男女样本的浓度均与经验结果一致,同时在DNBSEQ-T7及原有平台上检测这些蛋白时获得了高度一致的结果(如下图)。
图3. 部分男女间差异蛋白在DNBSEQ-T7的NPX值以及不同平台的检测结果比较
关于三方合作的序祯达生物Olink蛋白组学平台
从2021年序祯达生物与Olink建立合作伙伴关系,并成为Olink在中国的首批合作实验室之一,序祯达生物开始采用Olink专有的邻位延伸分析技术(Proximity Extension Assay, PEA),赋能端对端的多组学临床研究,以加速中国精准医学发展进程。2023年,序祯达生物与华大智造签署了战略合作协议,拓展了原有测序模式的可及性。
序祯达生物也是国内首家可提供Olink Explore、Target、Flex及Focus全系列产品的服务商,是国内首家通过Olink Target 48/96和Olink Explore质控标准的一致性验证的服务商,一直以来致力于提供满足国际标准的高质量的检测数据和服务。在Olink项目经验方面,已成功满足超过23种样本的检测服务,Olink Explore平台检测样本数也已达数万例,无论是检测经验还是交付质量,均处于国内领先地位。
序祯达生物创始人兼首席执行官孙乐乐博士表示:“序祯达生物是一家专业提供测序技术服务和多组学研究解决方案的服务型平台企业,多年来一直追求卓越的质量控制标准,拥有多台高通量测序仪,在测序服务方面一直走在行业前列。序祯达生物也是Olink国内首家服务商,2022年成为首家通过Olink Target 48/96和Olink Explore一致性验证的中国服务商,今年年初,又率先通过了Olink Explore HT检测的国内外实验室一致性验证评估且获得了国内首家官方认证,是Olink国内的具备国际质量的服务商。很荣幸在序祯达生物的平台可以见证Olink Explore数据能在华大智造的DNBSEQ-T7上产出且通过官方的QC认证,未来,多组学、测序将有更多的可能性,让我们共同期待。”
华大智造副总裁、中国区总经理彭欢欢表示:“此前,我们对DNBSEQ-T7的性能进行了全面升级,通量更高、速度更快、数据质量更佳,全方位赋能多组学研究发展。此次适配,将助力序祯达生物为其客户提供更优质、更高效、更专业的技术检测服务,为蛋白组技术及应用的发展注入强大动力。”