科技创新不能等待,春节期间,深圳华大生命科学研究院一项万人级全基因组科研项目依托新型计算技术加速完成。该项目通过华大智造ZTRON平台,对总计超过1.2Pbp的高深度全基因组测序(WGS)数据进行了ZBOLT计算分析加速,完成了基因组比对及变异检测分析,集中处理了超过2.5PB数据,比经典计算方案提速近300倍。
核心技术的自主可控带动测序成本不断下降,华大智造自主研发的高质量、高通量的DNBSEQTM测序技术极大地促进了国家基因组计划在内的大规模人群基因组研究与应用。海量基因组数据的分析处理需要高性能计算的加持,为科学家和临床专家提供准确、高效、可靠的计算分析平台支持。
“非常惊喜地看到如此海量的数据分析工作,依托华大智造ZTRON平台仅用10天左右就完成了,这极大地加速了课题的进度,为我们理解重大疾病的遗传机制提供了有力的支撑。同时,本地部署、封闭计算的模式也最大程度确保了数据的安全。”华大研究院群体基因组方向的首席科学家金鑫博士表示。
华大智造ZTRON平台于2020年推出,集成了自主研发的生信分析加速器ZBOLT,自动化资源调度平台,高性能存储及数据管理系统,提供每年每U高达2Pbp WGS生信分析加速能力,较传统分析方式加速300倍以上,存储每U高达0.48PB存储裸容量及多路100Gb/s的网络数据传输,大大加速了大型群体基因组数据的处理能力。同时,平台采用本地化部署,基于CRC32循环校验机制以及磁盘冗余阵列数据保护模式,有效地保障了数据传输和存储的安全性。
针对该项目分析需要,华大智造ZTRON平台提供了5.2PB可用容量的高性能基因数据存储,基于大型群体基因组数据文件特点实现性能的调优,实现了单节点带宽在10GB/s以上和多节点水平扩展,有力保障项目的分析工作,并支撑了大型群体基因组数据的存储。
华大智造ZTRON平台
目前,华大智造ZTRON平台已在全球范围内支持了十余个大型人群基因组项目的测序分析和数据管理工作,在基因数据存储、计算和管理等方面的表现可圈可点,具备充分的实力在未来支持更多科研项目的展开。
*该课题所涉及的数据已通过严格的伦理审批,并获得了科技部人类遗传资源办公室的批准。