助力防控登革热！华大智造推出ATOPlex DENV1-4靶向扩增建库试剂盒

随着全球变暖，蚊媒生存的范围逐渐扩大，导致登革热流行的地区范围也在逐年扩大。2023年以来，美洲和东南亚登革热病例激增，呈暴发态势。我国今年进入登革热流行季节以来，全国登革热疫情处于持续上升阶段。截至8月30日，全国25个省份报告病例数远高于2020-2022年同期水平，病例主要集中在云南以及广东、浙江、四川、湖南和福建等6省份。

已投入使用！

华大智造助力完成登革热病例病毒溯源

今年5月，华大智造＆汕头疾控“分子生物学前沿技术粤东区域培训基地”（以下简称“粤东培训基地”）在汕头市正式揭牌成立，旨在共同促进粤东区域生物安全体系建设，推动病原检测技术培养方案落地。为了进一步提升登革热防控能力，华大智造为粤东培训基地提供了可实现登革病毒快速鉴定及溯源的ATOPlex  DENV1-4靶向测序流程，相关设备及产品已开放使用。

图1 华大智造ATOPlex DENV1-4靶向测序流程

日前，华大智造助力登革热感染患者样本在粤东培训基地高效完成溯源。本次登革热样本溯源基于华大智造MGISEQ-200测序仪进行测序，采用PE100的测序方案，总耗时27h。

图2 汕头疾控工作人员基于华大智造设备操作登革病毒溯源

图3 登革热感染患者样本测序流程

经分析鉴定，9例样本为DENV1型，1例样本为DENV2型。10例样本均获得高质量基因组，最高基因组覆盖99.2%，CT值高至35的病毒样本也能获得86.1%的基因覆盖度。

图4 系统发育进化树（9例DENV1型样本与DENV1型参考基因组）

图5 SNP差异热图（9例DENV1型样本与DENV1型参考基因组）

比对基因组一致性序列绘制系统发育进化树是分析样本亲缘关系的常见生物信息学分析方法，报告中的SNP热图描述了样本两两比较（每个格子对应的行名和列名）的SNP数目差异，数字越小代表SNP差异越小、两个样本的基因组越一致。从系统发育进化树和SNP差异热图可以看出，此次溯源的9例DENV1型样本基因组相似度较高，尤其是Sample3、4、5、7、9、10。

为防控登革热提供有力检测工具

华大智造推出ATOPlex DENV1-4靶向扩增建库试剂盒

登革热是由蚊媒传播的传染病，主要发生在全球热带和亚热带气候地区，受气候影响，我国夏季多发于广东、广西、云南等地。对于登革病毒的检测，传统抗原和核酸检测存在假阳性，血清学检测具有窗口期，病原学检测依赖病毒分离，操作复杂且耗时久，不利于公共卫生监控系统快速、持续、有效的响应。

华大智造ATOPlex多重PCR建库试剂盒定制化平台，自其上市以来，由于其超高重PCR扩增的特点、兼具简单流程（单管两步PCR建库）和低投入量的优势，被广泛应用在病原微生物测序领域，在新冠、流感、猴痘、环境微生物的检测、监测、溯源等应用中均有不俗的表现。

基于ATOPlex多重PCR技术，华大智造推出ATOPlex DENV1-4靶向扩增建库试剂盒并开放试用，一管扩增登革热四个基因型，6小时内即可完成手工建库和DNB制备的操作，搭配华大智造DNBSEQ测序平台等设备，从核酸样本到分析报告，全流程最快17h内即可获得分析结果（搭配DNBSEQ-G99），为应对登革热疫情爆发提供有力检测工具。

图6 华大智造ATOPlex DENV1-4靶向扩增建库试剂盒

华大智造始终致力于成为生命科技核心工具缔造者，基于DNBSEQ与ATOPlex核心技术推出DENV1-4靶向测序流程，精准助力登革病毒溯源、防控、基础研究等环节，为我国传感染疾病监控、公共卫生工作的开展添砖加瓦。

未来，秉承“创新智造引领生命科技”的理念，在公共卫生应用领域，华大智造将持续致力于满足病原微生物全基因组测序、靶向测序和宏基因组测序全流程等应用场景的需求，为公共卫生事件的监测和预警提供更自动、更便捷、更高效的国产化核心工具。