2025年1月4日，华大智造SEQ ALL联盟年度峰会在北京举办，近300名来自不同领域的科研、产业机构、临床以及政府的专家学者们围绕“SEQ ALL”在科研、医学及产业应用方向的前沿技术和科研成果进行探讨。

厦门大学邓文波教授在报告中，高度赞扬了MGISEQ-2000RS FluoXpert多组学分析仪（以下简称“FluoXpert” ）在基础科研领域的关键作用。邓教授团队在分娩启动分子机制的相关研究中，使用FluoXpert完成了单细胞及时空组学发现的特异性marker验证，不但成功解析了基质细胞在分娩启动中的功能，还解析了上皮细胞的变化特征和空间定位。

厦门大学邓文波教授

早产是新生儿死亡最主要原因，也是出生缺陷和新生儿疾病的首要病因，早产可能是由于分娩启动机制的过早激活或异常调节引起的，而分娩启动的分子机制一直不明确，前期结果已解析母体蜕膜中的不同细胞类型[1]（图1），并通过空间转录组对分娩期不同细胞类型的特征表达基因进行了检测，通过深入研究这些基因背后的分子机制，为预防和干预早产提供了新的思路和方法。

图1. 单细胞测序解析了小鼠蜕膜第16天和第19天基质细胞的发育轨迹

核心议题：空间转录组

注释细胞类型遇到的问题

单细胞测序通过基因表达差异将细胞分群，而分群的细胞在组织上的空间位置如何，需要在组织原位上进行分析，时空转录组学可以通过时空条码还原空间位置，实现组织中基因空间的表达检测[2]。

时空组学基于Stereo-seq技术，通过DNA纳米球与坐标位置的映射关系，还原后续捕获到的mRNA 的空间位置（图2）[3]。然而，考虑到细胞在形态和大小方面所存在的差异，为了获得更为精确和直观的结果，往往还需借助蛋白荧光染色或RNA原位杂交等基于原位荧光成像的检测方法。这些方法能够为我们提供图像层面的进一步验证，从而确保研究结果的准确性和可靠性。

图2.时空组学技术原理[3]

为了进一步验证整合单细胞测序（scRNA-Seq）之后时空转录组的注释的准确性，邓教授团队借助FluoXpert多组学分析平台，在同一个组织上，对细胞特异性的11个分子标记进行多重免疫荧光染色，实现单细胞水平上的蛋白定位，验证了子宫内膜内弥散的适应性免疫细胞类群如CD4和CD8阳性细胞在子宫内膜的分布，这些免疫细胞对子宫内膜再生、分娩启动以及免疫耐受的建立中发挥着重要作用（图3）。这一结果也进一步验证了整合scRNA-Seq之后的Stereo-seq对弥散分布和细胞较小的细胞类型具有很好的注释效果。同时，这也在蛋白层面进一步佐证了基因表达信息解读的准确性。

图3. 人子宫内膜切片FluoXpertTM多重免疫荧光染色标记

FluoXpert平台：

多重优势助力多组学研究

FluoXpert平台基于华大智造MGISEQ-2000RS平台开发的多重免疫荧光染色技术，利用了循环间接免疫荧光法，搭配使用多重免疫荧光试剂套装，可检测多达24个蛋白标记物，最终呈现同一个样本单细胞水平、亚细胞分辨率的空间蛋白图谱（图4）。

图4. MGISEQ-2000RS FluoXpert平台

超多重免疫荧光：单张切片可实现多达20+蛋白标记物检测，大大节约珍稀样本。高效全自动染拍流程：通过软件控制自动化染色、拍照、洗脱循环，实现样本进图像出，操作简单。高重复性染色：多轮染色洗脱后抗原染色强度波动较小。兼容市售抗体：兼容市售一抗，使用荧光二抗间接标记，减少实验成本，信号放大效率比荧光直接偶联一抗的方式高。温和洗脱：保护组织结构，确保多轮染色的准确性。

未来展望

在报告中，邓教授提及其研究团队未来将继续基于FluoXpert平台，在空间转录组和空间蛋白组层面，解析内皮细胞在分娩启动中的功能，以及分娩启动的时空调控特征。

此外，邓教授团队在进行2-3蛋白标记三维重构过程中，观察到子宫内膜的上皮细胞在不同妊娠阶段动态变化。而华大智造研发团队也正致力于开发三维多重空间蛋白定位技术，以满足更多组学用户需求。未来，FluoXpert平台将助力更多基础科学发现和疾病机制研究，为临床转化和应用提供科学的技术保障！

参考文献：

[1] Zhao H, Wang Y, Xu H, Liu M, Xu X, Zhu S, Liu Z, Cai H, Wang Y, Lu J, Yang X, Kong S, Bao H, Wang H, Deng W. Stromal cells-specific retinoic acid determines parturition timing at single-cell and spatial-temporal resolution. iScience. 2023 Sep 1;26(10):107796.

[2] Gulati GS, D'Silva JP, Liu Y, Wang L, Newman AM. Profiling cell identity and tissue architecture with single-cell and spatial transcriptomics. Nat Rev Mol Cell Biol. 2025 Jan;26(1):11-31.

[3] Ao Chen, Sha Liao, Mengnan cheng, et al.Large field of view-spatially resolved transcriptomics at nanoscale resolution[J]. bioRxiv, Posted January 19, 2021.