肠道菌群是一个庞大复杂的生态系统,占全身菌群总数的80%左右,被称为人体的“第二基因组”。肠道菌群在促进人体消化及营养吸收、免疫调整、合成维生素和其他有益化合物、对抗病原体、影响人体情绪和行为上都发挥着重要作用。
近年来,全球范围内的科学家、医生及研究人员等开始加大对肠道菌群的研究,如2010年,华大发表在Nature封面上关于“构建人体肠道微生物参考基因集”的研究论文[1],开创了高通量测序研究人体肠道菌群的新时代,被称为21世纪前十年最重要的科研成果之一。
此外,一些大规模的肠道菌群计划——如华大智造DNBSEQ测序平台助力的“百万微生态”国际合作计划(MMHP)等也正在如火如荼地进行中。更重要的是,肠道微生物研究不仅仅停留在科研层面,也在临床应用中取得了进展,业界已经开始探索利用肠道微生物作为治疗和预防疾病的手段。
肠道微生物研究领域的兴起,也对样本收集提出了新的要求。在实际操作中,肠道微生物研究常常面临样本提取难,自动化程度低等难题,为此,华大智造推出了MGIEasy粪便基因组DNA(meta)提取试剂盒II。该试剂盒采用超强吸附性的纳米磁珠捕获技术,可以从人类粪便样本、唾液及拭子样本中提取纯化高质量的微生物基因组DNA,在纯度和样本丰富性方面有了很大的提升。
此外,华大智造也提供粪便样本全流程自动化提取产品组合,包括全自动MGISTP-7000分杯处理系统进行移液,基于MGISP-NE384、MGISP-960等不同通量的自动化设备完成核酸提取,满足用户在不同场景的提取需求。
产品亮点
样本类型广
可提取粪便样本、拭子样本及唾液样本等
提取效率高
有较高的提取产量和纯度
提供肠道微生物全流程产品组合
该提取试剂盒适配中/高/超高通量提取设备,配备粪便样本采集套装,提供从样本采集盒转移、提取、建库、测序到报告的全流程产品组合
性能介绍
01
不同样本类型提取性能优异
使用MGIEasy粪便基因组DNA(meta)提取试剂盒II分别对粪便样本(每个反应投入1mL粪便悬液250mg粪便样本左右)、唾液及口腔拭子样本进行提取。
结果显示:1)华大智造的提取试剂对不同类型样本的提取产量较高;2)华大智造的提取试剂对不同样本提取的纯度高:不仅A260/A280表现优异, A260/A230也具备很高的数值。表明该试剂盒能够兼容不同样本类型的提取,且提取性能优异。
表1:不同试剂盒对不同类型的提取结果
02
提供肠道微生物全流程产品组合
针对肠道微生物研究,华大智造推出了覆盖中/高/超高通量产品组合,优化及验证标准流程,实现了从样本前处理,提取,建库,测序到报告的全流程。通过搭配自动化设备,解决了粪便样本难处理自动化程度低、粪便样本处理体验差等问题,实现样本前处理高度自动化,很大程度上减少手工操作,大大提高提取效率。
图1:粪便宏基因组测序流程图
MGIEasy粪便基因组DNA(meta)提取试剂盒II搭配自动化提取产品组合,从提取结果可以看出:使用MGISP-960和MGISP-NE384对20份不同样本进行提取,核酸产量合格率高达100%(需求核酸产量≥200ng),且两仪器提取产量相当。
图2:不同设备提取的产量比较
产品信息
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参考文献:
[1]Qin J, Li R, Raes J, Arumugam M. et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature. 2010 Mar 4;464(7285):59-65.