单细胞测序技术解决了细胞异质性问题,极大地提升我们对生命系统认知的分辨率,已经成为生命科学研究的常规手段。华大智造单细胞平台在科研应用方面已经积累了一定的实践基础,涵盖多个研究和应用领域,如肿瘤研究、细胞图谱绘制、脑科学等。
截至目前,基于华大智造单细胞DNBelab C系列产品(3’RNA及ATAC),累计发表SCI论文65篇。其中,2022年发表36篇(包含2篇Nature主刊文章),2023年发表21篇(包括2篇Cell主刊文章),2024年2篇,累计影响因子超过1000分,是国产单细胞平台中可以在Nature、Science和Cell(简称CNS)主刊上发表多篇科研论文的平台。
华大智造的单细胞平台在科研应用方面涵盖广泛领域,尤其在肿瘤研究、细胞图谱绘制、脑科学、免疫学等领域贡献突出。文章研究的物种,除了最多的人和鼠分别占比33.8%和22.1%外,还涉及其他14个物种的研究(如猴、斑马鱼、蚂蚁、拟南芥等)。文章不止涉及单组学(RNA或ATAC)应用,还涉及多组学联合分析,包括多组学单细胞技术DNBelab C-3’RNA和DNBelab C-ATAC联合分析的文章有9篇,DNBelab C-3’RNA和时空组学技术Stereo-seq联合分析的文章8篇,相关研究具有多模态化、精细化、立体化的趋势,表明DNBelab C系列产品在单细胞领域的科研中发挥了关键作用,助力科学家们在相关科研领域的深入探索。
创新智造工具助力单细胞组学
进入标准化、规模化时代
华大智造自2019年推出国内首个DNBelab C4单细胞便携式平台以来,已经成功推出了三代单细胞3’RNA建库试剂盒产品。目前,第四代单细胞3’RNA-V3.0产品正在接受合作伙伴的试用,并已收获了广泛的好评,最新版本的产品是经过五年的精心研发和改进,采用了独特的多磁珠捕获细胞系统,性能卓越。
该产品的捕获效率稳定在50%以上,不使用样本标签情况下最多单张载片可以捕获2万个细胞,使用样本标签产品标记可进行混样测序,最多单通道可以捕获4.5万个细胞,以人类外周血单核细胞(PBMC)和小鼠脑细胞核样本为例,两个样本类型的平均每个细胞基因中位数检均可以达到2000个以上;这些突破性的优化,标志着华大智造在单细胞领域的技术和应用已达到新的高度,为生物医学研究提供了强大的工具,尤其在精准医疗和复杂生物系统的研究中展现出巨大的潜力。
人PBMC,投入细胞20,000,基因中位数2763个
小鼠脑细胞核,投入细胞核20,000,基因中位数2657个
此外华大智造在单细胞组学建库产品上还布局了单细胞ATAC建库试剂盒,单细胞CUT&Tag建库试剂盒,在硬件上基于液滴微流控技术推出了便携的C4系统和独立多通道的TaiM 4(泰山)单细胞液滴生成仪器可供选择;
便携C4和独立多通道TaiM 4、单细胞建库试剂盒
华大智造凭借具备原材料生产及加工的规模化能力,极大的降低了单细胞测序技术的成本,使得科研学者都能够更低门槛的进入单细胞研究时代,加上华大智造的高通量测序、自动化样本处理和建库、BIT数据处理产品的布局和华大时空组学的领先技术,对于细胞组学的布局形成了完整、全面的一站式平台和实验室前沿技术方案,促进更多科研学者能够规模化和标准化的产出单细胞数据。
MGI全流程单细胞产品
DCS多组学实验室
此外,华大智造注重单细胞测序技术普及应用的生态链建设,2023年新增哈尔滨星云生物信息技术有限公司、武汉爱基百客生物科技有限公司和华智生物技术有限公司三家认证服务商,国内累计完成认证的单细胞DNBelab C系列产品服务的公司达到12家。
2023年新增的三家单细胞DNBelab C系列产品认证服务商
2023年基于华大智造DNBelab C系列
单细胞平台发表的科研论文
附加:历年DNBelab C系列单细胞平台发表文章