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实测数据丨有效Reads数最高逾7000M,Q30均值超95%,T7性能全面提升!

时间:2023-10-12作者:华大智造阅读数:8006分享

6月,华大智造对超高通量基因测序仪DNBSEQ-T7性能进行了全面升级,并同步推出搭配的DNBSEQ-T7高通量测序试剂套装V3.0。升级后的DNBSEQ-T7最快可在24小时内生成至少7Tb的数据,有效reads数提升至少16%(≥5800M),数据质量Q30≥85%,打造了通量更高、速度更快、数据质量更佳的“超级生命计算机”。


近几个月以来,华大智造陆续向DNBSEQ-T7在不同应用领域的新老用户提供了升级服务。本文总结了6家用户基于升级版DNBSEQ-T7的实测数据,带大家了解升级版DNBSEQ-T7在用户端的优异数据表现。排除一些不可抗拒的外界因素干扰,基于升级版DNBSEQ-T7,用户端产出的有效reads数均超过5800M,个别用户的产出数甚至高达7000M+;数据质量方面,在WGS、 WES、 RNA等测序类型下,barcode拆分率(SplitRate)和Q30均值在95%以上;4联载片同时进行PE150测序的情况下,测序时间在24小时以内。





用户实测:测序产量、测序质量、测序速度全方位提升!


用户坐标:武汉

测评部门:生产交付中心

应用方向:WGS,WES,RNA,单细胞等

“基于此次升级后的T7测序仪,搭配最新的V3.0试剂盒,我们累计上机了约300张载片。应用文库类型包括常规WGS文库、真核转录组文库、单细胞文库等,平均产量为6170M reads/张载片,R1平均Q30为98%,R2 平均Q30为96%,其中单张载片的最高产量能够达到7000M reads以上;升级后的T7整体测序产量和质量有了明显的提升,单张载片的平均产量提升了约600M reads/张载片, R1 平均Q30提升了3个百分点,R2 平均Q30也提升了3个百分点。不仅如此,T7升级后的测序周期也明显缩短。此次DNBSEQ-T7的升级给我们带来了较好的体验。”





Total reads (M)、Q30 (%) 、SplitRate (%)的run间统计数据


均值数据

1Total reads (M):6551M2Q30 (%):95.4%3

SplitRate (%):98.9%

用户坐标:北京测评部门:实验中心

应用方向:单细胞,WGS,WES,RNA等

“全新的DNBSEQ-T7高通量测序试剂盒V3.0整体表现不错,使用后的测序产出总数据量高于升级前的V2.0试剂,令人满意。”





Total reads (M)、Q30 (%) 、SplitRate (%)的run间统计数据


均值数据

1Total reads (M):6782M2Q30 (%):97.5%3

SplitRate (%):97.7%


用户坐标:北京

测评部门:研发中心

应用方向:WGS,WES,RNA,科研肿瘤等

“通过对华大智造近期推出的DNBSEQ-T7高通量测序试剂盒V3.0的整体测序表现进行总结,我们对测序时间,测序质量如Q30及拆分率等数据都比较满意,run间的数据产出也比较稳定。”





Total reads (M)、Q30 (%) 、SplitRate (%)的run间对比数据


均值数据

1Total reads (M):7022M2Q30 (%):93.5%3

SplitRate (%):96.6%


用户坐标:上海
测评部门:生产部门

应用方向:WGS,WES,RNA,单细胞等

“目前我们已开始对DNBSEQ-T7高通量测序试剂盒V3.0进行一些测序条件的摸索,前几个测试run的Q30指标基本都能维持在90% 以上。我们对升级后的整体数据表现还是比较满意,后续会逐步从V2.0试剂切换到V3.0试剂。”




Total reads (M)、Q30 (%) 、SplitRate (%)的run间对比数据


均值数据

1Total reads (M):6330M2Q30 (%):95.0%3

SplitRate (%):95.5%


用户坐标:武汉

测评部门:交付中心

应用方向:WGS,WES,单细胞,ATAC-seq,全转录组测序等

“升级到V3.0试剂后,DNBSEQ-T7的数据产出量明显提升,基本在6000M上下,最高可达6500M。”





Total reads (M)、Q30 (%) 、SplitRate (%)的run间对比数据


均值数据

1Total reads (M):6498M2Q30 (%):95.1%3

SplitRate (%):98.3%


用户坐标:北京

测评部门:交付中心

应用方向:单细胞,WGS,WES,RNA,STO等

“DNBSEQ-T7高通量测序试剂盒V3.0能够适配不同应用类型,下机数据量、Q30、测序时间等参数表现符合华大智造官方所公布的数据范围。”





Total reads (M)、Q30 (%) 、SplitRate (%)的run间对比数据


均值数据

1Total reads (M):6285M2Q30 (%):96.8%3

SplitRate (%):94.9%


结语


基于升级版DNBSEQ-T7搭配高通量测序试剂套装V3.0的优异数据表现,华大智造收到了全球范围内越来越多用户对DNBSEQ-T7升级及高通量测序试剂套装V3.0订货的需求,新用户则直接考虑采购全新升级版DNBSEQ-T7及测序试剂套装。华大智造分布全球的售后服务团队将及时、持续为用户提供安装、升级、维护、培训等售后保障服务。


华大智造始终致力于通过提供先进的生命科技核心工具赋能全球用户及行业发展。截至2023年6月30日,华大智造拥有员工2,800人,业务布局遍布六大洲90多个国家和地区,在全球服务累计超过2,400个用户,并已在全球多个国家和地区设立科研、生产基地及培训与售后服务中心等。


注:本次升级面向华大智造DNBSEQ-T7的所有新老客户,老客户可享受免费升级服务(包含升级仪器控制软件,测序试剂套装按需购买),新客户可以直接选购升级版DNBSEQ-T7。目前,升级版DNBSEQ-T7及其测序试剂套装已开放供应,更多信息请与我们联系(4000-688-114) 或联系当地销售人员。

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