MGISEQ-2000RS FCL测序试剂套装因测序通量高、单G成本低而广受用户欢迎,但实际使用过程中,常遇到样本不够但又急需上机的情况,使得开机成本变高。为此,我们推出MGISEQ-2000RS FCS测序试剂套装,通量变小,更加易于凑样,同时速度更快,排机更灵活。让您多样化的小数据量测序,真正run起来、run更快!
图4 Early User FCS PE150应用文库数据表现
客户评价:
锐赛:
数据量小,能灵活排机、缩短实验周期。
康为世纪:
一直使用
精科:
FCS载片数据量和质量产出都符合预期,适合中小型实验室自主运行,节省成本。
吉因加:
数据产出及质量符合预期,期待正式版本早日发布。
MGISEQ-2000作为一款全能型高通量基因测序仪,可广泛用于WGS、WES、RNA、WGBS及Panel等各种文库类型,但随着用户类型和应用多样性的不断提高,众多企业和实验室对数据量小、但实验周期和排机灵活性高的试剂有着强烈的需求。为此,华大智造潜心开发了适用于全面型测序仪MGISEQ-2000的高通量快速测序试剂套装,该试剂套装经过了多轮内部测试,以及数据质量、测序速度方面的测评,在数据准确度、突变检出率、稳定性等关键性能方面表现优秀,通过早期用户的测试,也给与了一致好评。历经千锤百炼,现正式推出高通量快速测序试剂套装。
MGISEQ-2000RS 高通量快速测序试剂套装采用了FCS载片类型,通量相比FCL载片类型更小,同时对测序试剂某些关键组分进行调整,并减小拍照面积,大大缩短了单次运行周期。
近期,华大智造还将发布FCS试剂专属机型MGISEQ-2000RS FAST,一款更快速、更低门槛、更灵活经济的双芯片中通量测序仪,助力更多中小型企业和实验室快速发展。
(注:MGISEQ-2000RS 高通量快速测序试剂套装,以下简称FCS试剂套装。)
一、
载片速度更快
相同读长下,FCS载片比FCL载片提速50%。FCS载片在PE100测序时,运行时间仅需约26小时。在进行PE150测序时仅需约37小时。
凑样更容易
FCS单载片550M reads,凑样更容易,单次开机成本更低。
数据质量高
提速不降质,FCS数据质量与FCL相当。
兼容性好
兼容两款机型,除与现有MGISEQ-2000RS兼容外,专属机型MGISEQ-2000RS FAST即将发布。
MGISEQ-2000RS FAST
FCS载片
二、测试基本数据
为检测FCS试剂套装进行PE150测序时的性能,我们在4台MGISEQ-2000RS测序仪上进行测试。本次测试共有12张载片24条lane,包括标准文库16条lane,以及肿瘤检测、WGS和WES等应用类型,数据表现如下:
图1 标准文库样本FCS PE150数据表现
Total reads>300M/lane,CV=2.27%
Q30>88%,CV=0.95%
Split Rate>98%,CV=0.18%
数据结果显示,FCS PE150测序试剂套装在标准文库上数据量、数据质量和拆分情况均表现稳定。
与此同时,我们还测试了FCS试剂套装进行PE100测序时的性能。本次测试在2台MGISEQ-2000RS测序仪上进行,分为5张载片10条lane,包括标准文库9条lane,以及肿瘤检测等应用类型,数据表现如下:
图2 标准文库样本FCS PE100数据表现
Total reads >300M/lane,CV=1.96%
Q30>88%,CV=0.91%
Split Rate>98%,CV=0.36%
数据结果显示,FCS PE100测序试剂套装在标准文库上数据量、数据质量和拆分情况均表现稳定。
三、应用结果
应用方面,针对大家最为关注的肿瘤应用,我们进行了FCS及FCL试剂的数据对比:
表1 肿瘤样本下游分析结果
结果显示,在针对高频变异(>3%)的肿瘤样本检测中,FCS的表现略优于FCL,所有样本检出率均达到99%。其中针对中频变异(1%-3%)的检测结果完全满足实际需求。
四、综合评价
经过多轮测试显示,MGISEQ-2000RS 高通量快速测序试剂套装(FCS试剂套装)在数据准确度、突变检出率、稳定性等关键性能方面表现优秀,值得您的信赖。
MGISEQ-2000RS 高通量快速测序试剂套装现已上市,本次上市的套装包括FCS PE100和FCS PE150两种版本,欢迎订购体验!