如同曾经的超声和CT,近年来全基因组测序(WGS)也正在快速从一个行业词汇变成一个为大众普遍所接受的事物。对于个人来说,全基因组测序能够帮助发现潜在疾病风险、为每个人划定健康基准线。对于国家来说,大规模的全基因组测序项目将绘制出大人群精细基因组图谱,研究疾病健康和基因遗传的关系,加速对人类疾病的研究。大型测序项目需要更高效的测序系统,近日华大智造正式交付商用的超高通量测序仪DNBSEQ-T7,为实现这样的蓝图提供了有力的工具保障。
大人群基因组计划已成为趋势
近年来,全基因组测序的大规模普及已经成为趋势,2017年12月中国启动了十万人基因组计划,是我国在人类基因组研究领域实施的首个重大国家计划,覆盖我国大部分地区,除汉族外还将选择人口数量在500万以上的9个少数民族。
此外,英国、美国、阿联酋、法国、沙特、日本、新加坡等国也提出了类似的国家级全基因组测序项目。
全民测序需要新一代的测序平台,具备高样本通量、低成本、快速精准的自动化的样本处理、测序和生信分析能力。作为全球领先的高通量测序平台制造商,针对大人群测序的需求,华大智造开发了基于 DNBSEQ-T7的全基因组测序自动化平台。
五大亮点:华大智造全基因组测序自动化平台
作为全球领先的高通量测序平台制造商,针对大人群测序的需求,华大智造开发了基于超高通量测序系统 DNBSEQ-T7的WGS全流程自动化平台。
更强大
一台DNBSEQ-T7单日产能高达6T, 满负荷PE150小于24小时
更省时
单次运行时3天可产出一个run的数据,连续运行时每天可下机1个run数据
更高效
满负荷运行60样本/run/天,21600样本每年
(该数据基于一台MGISP960搭配一台DNBSEQ-T7的“1+1”组合,另有处理能力更强的“2+3”组合)
更经济
单个样本测序成本低至500美元
少人工
全流程一步定量,无复杂出入库流程,完成操作只需2-3人
高度自动化的测序全流程
华大智造全基因组测序
自动化平台囊括了从样本制备到报告输出的完整测序流程:
样本制备:MGISP-960
MGISP-960自动化样本制备系统
根据样本中的DNA制备出待测序的纳米球DNB
DNB加载:MGIDL-T7
MGIDL-T7自动化DNB加载系统
将DNB加载至测序芯片
高通量测序:DNBSEQ-T7
超高通量测序仪DNBSEQ-T7
24小时内完成测序和上下机文件Base-calling,并将下机数据存储至外接服务器
外置服务器
外接服务器将数据输入到生信分析系统
生信分析系统:MegaBOLT
MegaBOLT生信分析系统
进行高效数据分析,生称分析报告,并输回到服务器
Zlims实验室信息管理系统
在整个全基因组测序流程中,从样本制备到报告输出,都可用自主开发的“ZLIMS”实验室信息管理系统进行可视化管理。
两款高效配置组合
根据用户不同的样本处理规模,我们推荐两种配置组合:
1+1组合
1台MGISP-960 +1台DNBSEQ-T7+综合配件包
(1+1组合综合配件包:包括1台MGISP-100、1台MGIDL-T7、5套MegaBOLT生信分析软件、1套Zlims信息管理系统、外置服务器、UPS电源等)
该组合每run可处理的样本数为60个,年处理能力达21600个样本。
2+3组合
2台MGISP-960 +3台DNBSEQ-T7+综合配件包
(2+3组合综合配件包:包括1台MGISP-100、1台MGIDL-T7、15套MegaBOLT生信分析软件、1套Zlims信息管理系统、外置服务器、UPS电源等)
该组合每run可处理的样本数为180个,年处理能力达64800个样本。
华大智造全基因组测序自动化平台组合,具有很强的大规模样本处理能力。以英国历时五年半完成的的10万人基因组计划为例,采用1+1组合,可在四年半完成。如果采用2+3组合,一年半即可完成。而若给予同样时间,以“2+3”组合运行五年半,将能完成35万人的全基因组测序。
今天,越来越多的国家发起大人群全基因组测序计划,这类计划能够为个人疾病的预防和治疗提供全面的信息,更能够帮助人类深入研究和认识疾病。华大智造一直不懈地致力于为世界提供更加经济高效的测序工具,愿与行业上下游一同合作,让基因科技造福于人类。