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呼吸道微生物基因组测序组合产品

呼吸道微生物基因组测序组合产品以华大智造自主研发的试剂、自动化样本制备系统、高通量测序平台以及数据处理系统为基础,涵盖从RNA到结果输出的全流程,部分实验流程与全部数据处理流程可实现自动化运行。

本组合产品可对甲/乙流感阳性的RNA样本扩增病毒全基因组的8个片段,包括甲型HA(1-16)、NA(1-9)亚型流感和乙型Victoria与Yamagata流感,进行快速、准确、全面的高通量测序,从而为流感样本的全基因组扩增、分型、组装、溯源等应用等提供重要参考。



呼吸道微生物基因组测序组合产品

货号:
900-000070-00
MGISP-100RS 自动化样本制备系统(标准配置)
900-000350-00
MGISEQ-200RS 基因测序仪(配置2)
940-000549-00
MGIEasy 呼吸道微生物基因组建库试剂盒套装(16 RXN)
1000020570

MGlEasy 双barcode环化试剂盒(16 RXN)

1000019846
MGISEQ-200RS 高通量快速测序试剂套装(FCS PE100)
1000020834
CPAS条形码引物3试剂盒(3.5 mL)
970-000225-00

MGl FluTrack软件V1.0


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推荐方案




产品特点


多平台多环节深度整合,实现从样本到报告全覆盖

文库制备环节,借助 ATOPlex 多重 PCR 技术富集靶向区域片段,并在 MGISP-100RS 自动化样本制备系统完成 FostPCR-FREE 文库构建;测序与数据处理环节,使用 MGISEQ-200RS 测序仪进行 PE100 的测序策略,待测序完成后 MGIFluTrock 能够无缝执行数据的自动化分析。

检测性能优异,充分满足您的应用场景需求

适用于 Ct 值≤32 的甲型戏乙型流感样本,上靶率 On target rate 高达 99%,8个片段全覆盖,覆盖度高达 99%。

自动化程度极高,使用方便

借助 MGISP-100RS 自动化样本制备系统能够使实验中的多个环节实现自动化,MGIFluTrack 软件可以无缝连接测序数据与数据处理流程,实现结果自动输出,极大程度上减少全流程对于人工的依赖。

卓越的测序技术,助力于流感监测

华大智造独有的 DNB 和 cPAS 技术保证测序准确度和测序效率,为流感监测和流行病学调查提供有力支撑。

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性能参数

鉴定结果

利用FluTracK软件对MGISEQ-200RS的下机数据进行比对鉴定,软件将质控后序列比对至参考基因组,统计比对上甲/Z流参考序列的reads数,计算病毒相对比例Pct值,即Pct值=[甲或乙流序列数/(甲或乙流序列数+ 外参序列数)]*100%,由此判断甲/乙,流阴阳性,生成鉴定结果;同时完成甲/乙流的de novo组装,并依据位点覆盖情况生成深度分布图,组装序列和系别结果,鉴定结果如下。

片段覆盖信息

MGIEasy 呼吸道微生物基因组扩增试剂盒对流感病毒8个片段全基因组进行扩增,测序后经FluTrack软件比对分析,病毒各片段覆盖度均超过95%,片段覆盖度如下。


病毒溯源信息
测序数据经FluTrack软件比对后可对病毒进行溯源分析。软件将组装序列和数据库序列进行多序列比对,将最近缘的100个种构建进化树进行可视化展示。甲流采用三种溯源方式,全基因组、HA(Hemagglutinin)、NA(Neuraminidase)溯源,其中全基因组溯源是将组装的片段与包含所有8个病毒片段全基因组数据库进行比对溯源;HA溯源是将组装的HA片段与仅包含HA基因片段的数据库进行比对溯源;NA溯源是将组装的NA片段与仅包含NA基因片段的数据库进行比对溯源;乙流采用全基因组溯源方式。甲型流感和乙型流感标准品样本溯源结果如下。




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