近日,由21个机构和10多个参与国家共同努力的全球最大国际微生态研究计划——“百万微生态” (Million Microbiome of Humans Project,MMHP)披露最新进展,基于华大智造测序平台已完成样本量测序超13万例,较过去半年翻倍增长。
MMHP于2019年在国际基因组学会议(ICG-14)上正式启动,目标是在三到五年内对100万份人类样本的微生物DNA进行测序和分析,重点是粪便和唾液,旨在构建世界上最大的人类微生物组数据库。据了解,项目主要创始成员和联盟所在的核心实验室,如卡罗林斯卡研究所的AmbioGen、丹麦哥本哈根大学和法国国家农业科学院宏基因组研究所MetaGenoPolis将承担样本核心测序工作,而其他支持实验室,如德国ALACRiS Theranostics和法国Nahibu生物技术公司则发挥辅助支持作用。
MMHP联盟联合主席、瑞典卡罗林斯卡医学院微生物转化研究中心主任Lars Engstrand教授表示:“MMHP旨在利用高通量测序技术的进步,加速和推进宏基因组学研究,这其中一项重点工作就是如何创新和应用可大规模部署的最佳工作流程。这样所有的参与方都可以使用简化的流程,产生有价值的数据以促进高质量、全面的肠道微生物组图谱开发。”
在样品收集的同时,MMHP联盟基于华大智造测序和自动化产品,进行标准化技术工作流程的最终优化工作。这套完整的工作流程将适配测序实验中涉及的所有关键点,确保数据的质量与可靠性。
MMHP联盟联合主席、伦敦大学学院教授Stanislav Dusko Ehrlich教授表示:“一旦认识到人类微生物组组成对健康的重要性,微生物组分析在现代医疗实践的高结合度是很容易理解的。因此,加强对这个复杂的微生物世界的理解变得势在必行。通过传播这项技术并加速这一新兴领域的采用,我们的目标就是释放微生物组学在创新医疗解决方案的巨大潜力。”
与传统技术相比,随着宏基因组学的速度和精度越来越受到科学界的欢迎,MMHP联盟致力于通过向参考实验室转移技术来分享领域专业知识。在华大智造先进的测序技术、完善的实验工作流程及各项目成员的支持下,MMHP的目标是在2024年继续增强参考实验室矩阵的能力,使宏基因组学能够惠及人人。
MMHP前10,000个样本的性能分析结果证实了华大智造DNBSEQ测序平台具有高度一致性的表现。与常规DNA阵列相比,DNBSEQ测序技术具备低重复序列、低标签跳跃、信号密度高、平衡高通量和高质量数据的技术优势。借助DNBSEQ测序技术,参与机构能够扩展宏基因组学的应用和能力,有助于进一步开展相关研究和精准医疗。
除了可以接入标准化的微生物组分析协议和基于华大智造测序平台的鸟枪法宏基因组测序外,参与MMHP的其他好处还包括可以提前获取联盟生成的数据,并可成为相关研究论文的共同作者。该项目最终将实现100万份样本的测序和分析。当前,项目组欢迎医学、科学及业界机构的积极参与,共同为研究人类健康和疾病中的微生物组学作出贡献,改善全球健康。