高通量测序技术在发现新病原、识别已知病原和鉴定未知病原等方面发挥了关键的作用,现已成为常态化疫情防控的必要手段之一。根据《广东省疾病预防控制中心关于进一步做好全省疾控机构新冠病毒基因测序的通知》精神要求,为加强病原检测及溯源能力建设,华大智造联合佛山市疾病预防控制中心高通量测序技术创新应用联合研究中心发起的“病原靶向测序新方案-ADE自动化高通量测序技术培训班”于2022年9月7日-8日在广东佛山顺利举行!
来自广州、湛江、肇庆、潮州、河源、云浮等地疾病预防控制中心的10余名技术人员齐聚禅城,学习新技术、新知识、新方法,提高自身理论和专业水平。华大智造作为联合研究中心共建单位全程提供技术支持。
理论培训:ADE新方案弥合基层测序
能力建设“最后1公里”
佛山市疾病预防控制中心梁景涛老师阐述了举办此次培训的初衷:“佛山市疾病预防控制中心在2020年5月便具备了自主测序能力,并依托中心实验室成立全国首个公共卫生领域‘高通量测序技术创新应用联合研究中心’,为测序能力建设和人才培养提供平台支撑。但是,实验操作时间长,建库流程和仪器维护繁琐等问题成为了阻碍基层测序能力建设的‘最后1公里’。希望通过此次培训以新技术、新知识的讲解讨论,为这一问题的解决提供新方法、新思路!”
9月7日全天的理论培训涵盖病原测序应用场景、ADE自动化高通量测序产品组合以及病原生信分析策略的详细介绍。微生物高通量测序通常采用宏基因组/转录组测序、靶向测序、全基因组测序三种策略,广泛应用于感染性疾病诊断、公共卫生、肠道微生物、食品安全、动物疫病和环境健康等领域。
华大智造ADE自动化高通量测序产品组合是ATOPlex多重PCR建库定制平台、DNBelab-D4数字化样本制备系统和DNBSEQ-E系列测序仪三款产品的组合,突破性地解决了测序建库步骤繁琐、TAT时间长的痛点,一体化试剂盒即用即抛避免了繁琐的仪器维护。
基于ADE自动化高通量测序产品组合最快可在12小时*左右完成新冠病毒溯源分型,应对快速发现、准确变异跟踪的疫情防控需求。
实操体验:
上手无门槛开箱即用,高度自动化解放双手和时间
9月8日为实操体验培训,参会学员现场操作,全流程体验华大智造ADE自动化高通量测序产品组合。
DNBelab-D4与DNBSEQ-E系列大小相当30厘米见方,插电即可搭配使用。DNBelab-D4开创性地实现“一卡建库,集成定量”,在一张样本制备卡上即可完成DNA到DNB的全流程制备过程,并且系统集成自动定量功能,可在DNB制备完成后进行自动定量,无需手工定量。参会学员上午进行了DNBelab-D4实操体验,从核酸样本到测序文库构建完成,只有20分钟左右的手工操作,当天16时左右4个样本的文库定量结果自动出现在DNBelab-D4的屏幕上,全部成功!
DNBSEQ-E系列基因测序仪采用独有的自发光测序技术,可实现碱基序列的快速读取,最大支持25M数据通量,一体化试剂盒即用即抛,内置集成生信分析流程,从上机测序到报告输出一键直达。
华大智造ADE自动化高通量测序产品组合极大降低了测序技术门槛,解放操作人员的双手和时间,减少空间的占用,解决移动部署的问题,能够真正助力更多疾病预防控制中心具备本地化“一锤定音”的病原检测、溯源能力。
参训反馈“以往的建库方案都比较繁琐且容易出错,这次培训使用的DNBelab-D4相比起来实验流程简单很多,感谢佛山市疾控中心同仁组织的这次培训。”
——广州市疾病预防控制中心 侯水平
“参加这次培训受益匪浅,最大的惊喜是DNBSEQ-E5竟然不需要清洗维护,这相对于MGISEQ-200的流程确实简单了很多。”
——肇庆市疾病预防控制中心 谭翰清
关于“高通量测序技术创新应用联合研究中心”
2020年8月6日,佛山市疾病预防控制中心与深圳华大智造科技股份有限公司签订合作备忘录,依托本中心成立全国首个公共卫生领域“高通量测序技术创新应用联合研究中心”。首个公共卫生领域创新应用联合研究中心落地佛山疾控
*因操作熟练程度和样本量不同,实际完成时间可能会有差异。