超强毒株来袭 挑战疫情监测系统

截止日前，新冠疫情造成超过2.6亿人感染，超500万人死亡。WHO发布的数据显示，世界疫情已经经历了三波高峰。11月11日，就在全球普遍认为第三波疫情持续放缓之时，最新变异毒株B.1.1.529超越正在流行的优势株Delta毒株，成为了最新的强势毒株，该毒株被WHO命名为Omicron。根据Nextclade最新的数据，Omicron变异株包含61个氨基酸突变，对应到核酸序列上有50个新型变异，包括6个缺失突变和44个碱基替换突变（https://covariants.org/variants/21K.Omicron）。其中，刺突蛋白上有30多个突变，包括关键部位ACE2受体RBD区域的10个突变，很可能影响到现有疫苗的疗效。 

基于多重PCR核心技术，华大智造ATOPlex平台推出V3.0版建库试剂盒应对疫情挑战。ATOPlex V3.0试剂盒采用双保险引物设计，在一次实验中同时对病毒基因组进行2次扩增，任意一管都可以扩增出接近新冠全长序列，有效降低由于病毒突变带来的失败风险。

如上图所示，Pool1和Pool2两套不同引物池分别扩增一个完整的新冠全基因组，从而有效降低由于毒株突变带来的引物扩增失败的风险，为持续有效地检测新型未知突变株提供有力保障。

华大智造在第一时间拿到Omicron序列后就完成了对ATOPlex试剂盒的溯源性能评估，ATOPlex V3.0建库试剂盒联合DNBSEQ测序系统能够有效对Omicron毒株进行分析，基因组覆盖度超过99.2%，在鉴定新型突变的同时获取完整基因组序列。

 ATOPlex V3.0设备属性

华大智造密切关注新冠突变情况，自疫情暴发初期开始，就通过核心产品基因测序仪和自动化设备为全球70余个国家疫情防控提供工具支撑。随着疫情的不断变化，华大智造将持续更新和优化包括建库测序系统在内的产品及平台，为新型突变和疫情监测提供更有力的工具保障，助力全球抗疫！