近期,南非最新发现的超强新冠病毒变异株Omicron(B.1.1.529)在全球迅速蔓延,为疫情防控监测系统带来了巨大挑战。11 月 29 日 16 时,瑞典斯科纳地区报告一例新冠确诊病例为Omicron变异株。该变异株是在一周多前从一名居住在斯科纳地区的人身上采集的样本中检测到的,该公民一周以前刚从南非回国。
在此背景下,瑞典公共卫生署合作的卡罗林斯卡医学院国家疫情中心使用了华大智造ATOPlex建库试剂盒和MGISP高通量自动化建库平台在第一时间发现了Omicron变异株,100X基因组覆盖度超过98%。
ATOPlex平台助力瑞典第一时间发现Omicron变异株
据了解,南非发现的新冠病毒变异株Omicron(B.1.1.529)含有大量突变,很可能具有更强的传染性和免疫逃逸性。世卫组织建议各国采取多项行动,包括加强病例监测和测序,在公开可用的数据库(例如 GISAID)上共享基因组序列,以更好地了解Omicron是否具有不同的传播或疾病特征,或是否影响疫苗、治疗、诊断或公共卫生和社会措施的有效性。
针对此次新发现的变异毒株,华大智造以超高重PCR技术为核心的ATOPlex平台开发的建库试剂盒助力瑞典第一时间发现Omicron变异株。同时,它还能够获取毒株全基因组序列,为新型毒株监测提供强有力的工具支撑。
瑞典新增一例新冠确诊病例为Omicron变异毒株(图片来源:“最瑞典”微信公众号)
通过数据分析结果证实,ATOPlex平台开发的建库试剂盒(高通量测序法V1.1/V2.0/V3.0)针对Omicron变异株均可以进行有效的变异和溯源监测。华大智造一直在对新型变异株进行分析,持续开展对突变毒株的能力评估,保证ATOPlex试剂盒性能,助力全球疫情监测!
此外,ATOPlex平台还涵盖了DNA、RNA和DNA甲基化方向,可以满足科研、医药、食品安全、农业、DTC等相关领域的个性化基因检测产品定制需求。在微生物研究领域,ATOPlex技术不仅可以有效对Omicron和其他新型毒株进行分型和监测,还能针对其他威胁人类健康的病原微生物提供个性化的监测方案,满足公共卫生领域对于不同微生物的检测和监测需求。