《你问我答》栏目搜集了华大智造客户的常问问题,并为大家整理出了不同产品的FAQ,后续将陆续发布,帮助您更好地使用我们的产品。
文章导览:
Q1:DNBelab-D4 的功能包括什么?
Q2:DNBelab-D4 的通量是多少?
Q3:DNBelab-D4 的运行时长有多久?
Q4:DNBelab-D4 是否含有定量功能?
Q5:DNBelab-D4 手工如何操作?
Q6:DNBelab-D4 如何防止气溶胶和交叉污染?
Q1:DNBelab-D4 的功能包括什么?
DNBelab-D4 可完成酶切打断、接头连接、PCR、磁珠纯化、片段筛选、核酸定量、DNB制备等建库步骤。用户在 DNBelab-D4 上投入核酸(DNA和/或RNA),中间所有建库步骤全自动完成后,随后取出建库产物(双链DNA文库或DNB),同时 DNBelab-D4 给出建库产物浓度和建议投入量。
Q2:DNBelab-D4 的通量是多少?
DNBelab-D4 一次运行1张样本制备卡,1张样本制备卡有4个通道,通常支持至多4个样本/运行的建库流程。
Q3:DNBelab-D4 的运行时长有多久?
在完成手工加封闭液、建库试剂和样本(预计耗时15分钟内)并将样本制备卡放入DNBelab-D4(以下简称为D4) 后,D4开始自动运行建库流程。
D4的运行时长视建库方案有所不同,以DNBelab-D4RS 酶切DNA文库制备试剂套装V2.0(940-001198-00)为例,该试剂套装的建库方案为包含PCR的通用建库流程(包含酶切打断、末端修复、加A尾、磁珠纯化、接头连接、磁珠纯化、PCR、磁珠纯化、DNB制备,DNB定量),可应用于简单基因组组装、mNGS等应用,D4运行时长为3小时20分钟(包含内置自动定量)。
通常,针对相同的建库方案,D4的运行时长不会长于手工建库时长。
Q4:DNBelab-D4 是否含有定量功能?
DNBelab-D4 内置定量模块,采用荧光染料,可全自动地完成双链DNA文库定量或DNB定量,在结果页面给出核酸浓度的结果。
Q5:DNBelab-D4 手工如何操作?
采用 DNBelab-D4(以下简称为D4)的标准建库试剂盒,用户需在样本制备卡上手工加封闭液、建库试剂和样本,预计耗时在15分钟内。随后将样本制备卡放入D4,后续所有建库步骤均由D4自动完成,在D4结果页面显示各通道的建库产物定量结果。将样本制备卡从仪器中取出,用户需手工将建库产物从样本制备卡中取出并去除封闭液。随后可根据测序要求进行文库混合。
Q6:DNBelab-D4 如何防止气溶胶和交叉污染?
DNBelab-D4 采用独特的全封闭体系,在建库过程中所有液滴始终被封闭液包裹,包括实验过程中产生的所有废液也被封闭液包裹并保留在样本制备卡上,与外界空气完全隔离,相当于全流程“无开盖”。各反应体系之间相互独立,从而完全避免了气溶胶产生,杜绝外源污染和样本交叉串扰。目前已在 mNGS、tNGS、肿瘤小panel 等测序应用进行交叉污染验证,结果均表明 DNBelab-D4 在建库流程可实现“零污染建库”。
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