猴痘纳入乙类传染病管理！华大智造病原微生物靶向测序产品组合助力猴痘高效监测

9月15日，国家卫生健康委员会发布公告称，考虑到猴痘疫情将在我国一定时期内持续存在，为进一步科学规范开展猴痘疫情防控工作，切实保障人民群众生命安全和身体健康，国家卫生健康委决定，自2023年9月20日起将猴痘纳入《中华人民共和国传染病防治法》规定的乙类传染病进行管理，采取乙类传染病的预防、控制措施。

根据中国疾控中心公布的数据，3个月内，中国内地本土猴痘病例累计已经超过千例。《中华人民共和国传染病防治法》规定，疾病预防控制机构应当主动收集、分析、调查、核实传染病疫情信息，接到乙类传染病疫情报告或者发现传染病暴发、流行时，应当立即报告当地卫生行政部门，由当地卫生行政部门立即报告当地人民政府，同时报告上级卫生行政部门和国务院卫生行政部门。

为了助力疾控系统提升应急溯源能力，华大智造已经为各级疾控中心提供了可实现猴痘病毒快速鉴定及溯源的病原微生物靶向测序产品组合，相关设备及产品已投入运营。

内地首例后，华大智造再助力深圳疾控

完成深圳首例猴痘病例病毒溯源

今年6月，深圳市疾病预防控制中心（简称深圳疾控）基于华大智造病原微生物靶向测序产品组合完成深圳首例猴痘病例病毒溯源，相关文章被Biosafety and Health杂志接收并于8月发表。

截图自Biosafety and Health杂志

6月8日22时整，深圳市疾病预防控制中心接到福田区疾控中心通报的一例猴痘疑似病例，并立即抽调人员开展流行病学调查，收集了大量样本用于猴痘病毒的分子检测和病毒测序。

该次溯源采用华大智造ATOPlex多重PCR技术开发的猴痘病毒靶向测序Panel对猴痘病毒基因组富集及测序文库的构建，建库流程搭配了MGISP-960高通量自动化样本制备系统，实现了高效自动的实验流程。使用一步法制备DNA 纳米球 (DNB)，而后在DNBSEQ-G99测序仪上对 DNB 文库进行测序，并使用华大智造MPXV软件包对测序数据进行了分析，从而确定突变位点、共有序列和猴痘病毒谱系，最终在短时间内得到了高度可信的毒株序列全长。

研究人员通过基因组测序的Nextclade分析（https://clades.nextstrain.org/），确定了深圳三例病例均感染了人类猴痘病毒（hMpxV，B.1.3进化分支）。对已识别的猴痘病毒进行进一步的溯源研究，研究人员对全球所有B.1.3基因序列进行了系统发育树分析，发现深圳和杭州的四个本地病例与最近许多日本猴痘病例处于同一进化分支上。从进化的角度来看，这四个中国病例与2023年1月、2月和3月收集的日本株系（GISAID ID: EPI_ISL_17445514，EPI_ISL_17445515，EPI_ISL_17692269）高度同源。

中国深圳发现的3个MPXV的系统发育树，45个MPXV（样本采集时间为2023年1月1日至2023年7月3日）下载于GISAID

快速、精准，华大智造病原微生物靶向测序产品组合

为猴痘监测“一锤定音”

此前，华大智造于2022年9月助力中国疾控中心完成内地首例输入性猴痘病例病毒溯源，该次溯源基于华大智造当时刚发布的最新款基因测序仪DNBSEQ-G99等设备进行全基因组测序，在短时间内得到了高度可信的毒株序列全长。

为进一步提升猴痘病毒溯源工作的效率，华大智造推出病原微生物靶向测序产品组合，基于ATOPlex多重PCR技术开发了猴痘病毒靶向测序Panel，含739重PCR引物，覆盖病毒全长基因组，可对病毒进行相对定量，搭配华大智造DNBSEQ测序平台和MPXV分析软件以及MGISP-100或MGISP-960高通量自动化样本制备系统，实现从样本到报告的全流程支持，具有数据质量优异、基因组覆盖全、自动化程度高等特点，为猴痘病毒的监测与溯源提供强大工具。

ATOPlex多重PCR 技术，是华大智造自主研发的超高重 PCR 核心专利技术，可针对目标区域进行引物设计，并提供Panel和建库试剂等一整套方案，实现精准高效的病原微生物靶向测序。除此之外，该技术平台还可应用于司法、农业、肿瘤等多个领域，提供全面、专业的靶向测序产品。

华大智造病原微生物靶向测序产品组合

华大智造设备与软件在猴痘病毒监测应用中已经积累了一定的实践基础，成功助力中国疾控中心、地方疾控等多个公共卫生机构对猴痘病毒进行病毒识别与溯源。面对不断产生的疫情挑战，华大智造始终秉承“创新智造引领生命科技”的理念，持续提升技术平台和核心产品，致力于满足病原微生物全基因组测序、靶向测序和宏基因组测序全流程等应用场景的需求，为传感染病的监测和预警提供更自动、更便捷、更高效的核心工具。