用户测评 | ABclonal基于华大智造DNBSEQ-G99平台验证平末端建库测序

随着高通量测序技术的飞速发展，更加精准的检测手段不断在肿瘤领域拓展应用场景，迭代传统的检测技术。基于伴随诊断行业的不断成熟，精准诊疗的应用有所延伸。从早筛到MRD检测、伴随诊断，肿瘤精准诊断覆盖了全周期。突变+甲基化的联合检测或可提高肿瘤检测效率，也是目前国内外在技术创新上主要探索的方向，而联合检测的结果判读还需要更多的底层生物学研究和核心工具的支撑。

近期，ABclonal推出平末端建库试剂盒（BK0088)，搭载华大智造G99测序平台后，测序速度全面提升，而且G99平台下机数据的Q30、 捕获效率与dup率等优异质量表现，展现出在ctDNA检测肿瘤突变（液体活检）方面的应用潜力。G99灵活简单的特点和优异的检测性能为肿瘤的精准检测提供工具的支撑并开启更多可能的应用场景。

本次测评中，ABclonal分别在华大智造G99测序平台及A测序平台上机测序，并基于现有平台的生信算法进行分析，结果表明：两款测序平台的数据产出质量高且突变检出结果高度一致。

材料与方法

建库方案：ABclonal选用ctDNA标准样品，采用平末端建库试剂盒（BK0088)和内部Panel进行建库

测序平台：华大智造G99测序平台和A测序平台

测评数据

（1）稳定优异的连接效率和优异的文库产量   

图1 接头连接效率（灰色 BK0088, 黑色 Competitor2） 图2 ctDNA建库产量

图1中，毛细电泳检测单一片段进行接头连接效率，分别投入5ng（ 1% VAF），10ng （0.2% VAF），40ng （ 0.1% VAF）样品，ABclonal SWP技术(BK0088试剂盒）在不同DNA起始量的连接效率均达到80%以上，在低起始量投入下，SWP技术会高于传统TA连接建库技术的连接效率。

图2中，测试5ng（ 1% VAF），10ng （0.2% VAF），40ng （ 0.1% VAF）样品，等比混合进行杂交捕获，分别在G99测序平台和A测序平台上进行测序，测序下机后进行相关数据分析；不同投入量ctDNA样品，在相同的循环数和条件下，BK0088 SWP试剂的产量优异

（来源：ABclonal整理， Competitor和Competitor2分别表示SWP技术同类型试剂盒和传统TA连接试剂盒）

（2）测序数据产出质量好，平台间一致性高

从G99和A平台的下机数据来看，Q30值都比较高，这表明数据产出质量高；平均测序深度，mapping比例，捕获效率表现一致性好。图3 A平台测试数据

图4 G99平台测试数据

图5 G99与A平台测试数据

（来源：ABclonal整理， Competitor和Competitor2分别为SWP技术同类型试剂盒和传统TA连接试剂盒）

测试总结

BK0088建库试剂盒搭载华大智造G99双端测序平台后，测序速度提升明显；而且， G99平台下机数据Q30, 捕获效率与dup率等表现优异，在ctDNA检测肿瘤突变（液体活检）上展示出较好的应用前景。